בלשכת יו"ר הרשות הפלסטינית, אבו מאזן, מזהירים מפני קיום "צעדת הדגלים הפרובוקטיבית, ומהחלטת בית המשפט הישראלי לאפשר קיום טקסים תלמודיים ברחבת מסגד אל-אקצא המבורך".
בהודעה שפרסמה הלשכה נכתב: "החלטת בית המשפט היא פגיעה מסוכנת בסטטוס קוו ההיסטורי בהר הבית וניגוד גמור לחוק הבינלאומי". בלשכת יו"ר הרשות דרשו שהממשל האמריקאי יתערב באופן מיידי כדי לעצור את המתקפות הישראליות על העם הפלסטיני.
משרד החוץ הפלסטיני גינה את החלטת בית המשפט שלטענתם מפרה את הסטטוס קוו באופן רשמי והזהירו מפני מלחמת דת: "אסור לאפשר ליהודים קיצוניים לפלוש למסגד אל-אקצא ולקיים תפילות וטקסים תלמודיים. זו הצהרה ברורה על מלחמת דת שתפוצץ את זירת הסכסוך והאזור כולו". כמו כן, הטילו את האחריות המלאה של השלכות ההחלטה המסוכנת על ממשלת ישראל.
גם בחמאס כמובן הגיבו להחלטה וציינו כי "ההחלטה לאפשר קיום טקסים תלמודיים ברחבת אל-אקצא הוא משחק באש וחצייה של כל הקווים האדומים". בדומה למשרד החוץ ברמאללה גם בעזה הטילו על ישראל את האחריות על "ההסלמה המסוכנת וההשלכות שההנהגת הכיבוש תישא בהשלכותיהן". בהודעת החמאס נאמר כי "כל שטח אל-אקצא שייך למוסלמים בלבד והריבונות עליו שייכת לעם הפלסטיני. תושבי ירושלים והעם הפלסטיני כולו יגיב נגד התוכניות האלו ולא נאפשר להן להתקיים".

ארגוני הטרור בעזה העבירו מסרים בהולים למתווכים שהזהירו מפני "ההסלמה הישראלית אחרי החלטת בית המשפט לאפשר לקיים טקסים דתיים בהר הבית".
.
העיתון אל-קודס, דיווח כי ארגוני הטרור לא יוכלו לשבת בחיבוק ידיים אל מול הניסיונות של ישראל להבעיר שוב את האזור. הארגונים הבהירו למתווכים כי הם ערוכים להגן על מסגד אל-אקצא והמקומות הקדושים לאסלאם בכל מחיר. עוד נכתב בעיתון, כי צעדת הדגלים תעבור בעיר העתיקה וחבר הכנסת, איתמר בן גביר, יגיע להר הבית באותו יום ויוביל את הצעדה
גם במשרד החוץ הירדני גינו את החלטת בית המשפט לאפשר את מצעד הדגלים בהודעת המשרד נכתב כי "ההחלטה לאפשר לקיצונים לקיים טקסים ברחבת מסגד אל-אקצא. חסרת כל מעמד חוקי ונוגדת את החוק הבינלאומי וההחלטות הקודמות שנגועות לירושלים. ההחלטה מהווה הפרה מסוכנת של הסטטוס-קוו ההיסטורי והחוקי הקיים במסגד אל-אקצא. הממלכה לא מכירה בסמכות של בית המשפט הישראלי על ירושלים הכבושה".
דובר משרד החוץ הירדני הכריז "המסגד על כלל שטחו הוא מקום פולחן למוסלמים בלבד".