בימים האחרונים יחידות עוצבת הקומנדו פועלות כחלק מהמבצע לסיכול טרור בג׳נין שבחטיבת מנשה.
במהלך הפעילות לוחמי עוצבת הקומנדו חיסלו מחבלים וביצעו פעילויות מעצר מיוחדות, בהן נעצרו עשרות מחבלים. הלוחמים איתרו והשמידו מטענים, כלי נשק ואמצעי לחימה רבים.
בנוסף, הכוחות איתרו והשמידו מחרטה לייצור נשק ושני מחסני אמצעי לחימה בהם תחמושת וציוד לחימה.