בעקבות נפילת חוק תקנות החירום ביהודה ושומרון, פנו היום (ד) ראשי תנועת 'הביטחוניסטים' לשר הביטחון בני גנץ, בשם למעלה מ-4,000 קצינים בכירים בדימוס החברים בתנועה, והביעו חשש מהשלכות נפילת החוק על המצב הביטחוני. עוד הביעו חשש מכך שלדבריהם "נפילת חוק תקנות חירום ביו"ש עלולה להוביל לשחרור מאות מחבלים מהכלא".
חוות הדעת עליה חתום בין השאר ראש התביעה הצבאית ביו״ש לשעבר, סא"ל במיל' מוריס הירש, מזכירה כי "הנושא הביטחוני המרכזי שמוסדר בתקנות הוא בתחום יחסי הגומלין באכיפת חוק בין ישראל לבין יו"ש, בדגש, לעניינו, על פעילות האכיפה נגד טרור ומחבלים". נפילת התקנות מעוררת לא מעט בעיות בהקשר זה.
כך למשל על פי חוות הדעת, כיום, הפרקטיקה הנוהגת היא שהנעצר ביו"ש בגין חשד לביצוע מעשי או מעורבות טרור נחקר ע"י רשויות החקירה, במתקני החקירה בישראל. חשודים אלה אינם עצורים מכוח הדין הישראלי, אלא מכוח הסמכויות הקבועות בתחיקת הביטחון. לדברי החותמים "הבעיה בהקשר, הינה ברורה. החוק הישראלי קובע שאסור לרשויות להחזיק אדם במעצר ללא אסמכתא ומקור סמכות שמעוגן בחוק של הכנסת. היות והחשודים שנתונים במעצר לא נעצרו מכוח הדין בישראל, אזי נדרשת הוראה שתיתן תוקף לפקודות המעצר שהוצאו מכוח תחיקת הביטחון. תקנות יו"ש הן אלה שנותנות גושפנקא חוקית, בישראל, לפקודות מעצר שהוצאו ביו"ש".
"בנוסף", ממשיכים כותבי חוות הדעת, "הסדרים אלה מאפשרים את ההחזקה בישראל של נאשמים שעומדים לדין בפני בתי המשפט הצבאיים ביו"ש ונתונים במעצר עד תום ההליכים המשפטיים בעניינים ואלה שכבר הורשעו והוטלו עליהם עונשי מאסר, ובכלל זה מחבלים רוצחים. מכוח הוראות אלה, מוחזקים בבתי הסוהר של שב"ס, בישראל, בכל רגע נתון, לפחות בין 3,000 ל-3,500 מחבלים. בעוד שניתן למצוא פתרון אפשרי להמשך קיומם של הליכי החקירה במתקנים הקיימים של רשויות האכיפה ביו"ש, קשה למצוא מקום ביו"ש, להמשך החזקתם של אלפי מחבלים אסירים".
"בכל דורות מתיישבי ארץ ישראל גם עבור אלו שהיו מוכנים לסגת ממרחבי יהודה ושומרון הנתונים בשליטת ישראל, היה קיים רוב ישראלי מובהק שאינו מסכים עם גישת הנסיגה ללא תמורה וערבויות ביטחוניות", אומר מפקד הגייס המטכ"לי לשעבר ואחד מראשי תנועת 'הביטחוניסטים', האלוף במיל' גרשון הכהן. "על כן, קיימת בשל כך הסכמה רווחת בציבור הישראלי שלפחות לבינתיים, המשך החזקת המרחב הוא אינטרס ביטחוני מהמעלה העליונה. כאן הדרישה לחידוש החוק מבטאת צורך הלאומי מוסכם של כלל הגורמים הציוניים בממשלת ישראל לדאגה לצרכי הביטחון של ההתיישבות".
