משרד החינוך מימן ב-2018 סיור של עמותת "עיר עמים" עבור מורות חיילות. ארגון השמאל פועל מזה עשרים שנה בירושלים, רוב מימונו מגיע ממדינות זרות כמו שבדיה, נורבגיה והאיחוד האירופי וגם מקרנות שמאל כמו הקרן החדשה לישראל ו"המכון לחברה פתוחה".
טענתה המרכזית של העמותה, שפועלת במזרח ירושלים, היא שממשלות ישראל פועלות "לייהד" את האזור. מנכ"לית הארגון, יהודית אופנהיימר, אמרה בעבר כי בניית פארקים לאומיים המקדמים "נרטיב לאומי-יהודי ברור" כופה נוכחות ונרטיב ישראליים על העיר העתיקה, ובכך לטענתה מעלימה את הנוכחות הפלסטינית בירושלים.
בשנת 2018 מימן משרד החינוך סיור עיר עמים עבור מורות חיילות. מדובר בהשתלמות שנעשתה על ידי אגף מטה מנהל חינוך התיישבותי, במסגרתה שילמו לעמותת השמאל 1,500 ש"ח. במסגרת אותה השתלמות זכו החיילות גם לסיור מטעם עמותת אלע"ד, שמנהלת את הגן הלאומי עיר דוד, אך גורם במשרד החינוך אומר שהמימון לסיור של אלע"ד היה מטעם צה"ל.
בצבא אומרים שהרצאות וסיורים מטעם עיר עמים לא יתקיימו להבא. "יחידת המורות החיילות הינה יחידה בכפיפות משותפת למשרד החינוך ולצה״ל, ומתוקף כך המורות החיילות מוכשרות על ידי משרד החינוך. התוכן המדובר הועבר במסגרת השתלמות שעסקה בדעות וזרמים שונים בחברה הישראלית, אשר תכניה נקבעו על ידי משרד החינוך. עם היוודע המקרה בוצע בירור בנושא שלאחריו חודדו הנהלים מול משרד החינוך וסוכם כי הרצאות מסוג זה לא יתרחשו בעתיד", נמסר מטעם דובר צה"ל.
בשנים האחרונות פועל ארגון עיר עמים נגד מצעדי הדגלים בירושלים. בשנת 2017 יצאו בקמפיין לביטול פרס ישראל שניתן לדוד בארי, מנכ"ל עמותת אלע"ד, משום ש"העמותה והמדינה משתמשים באתר עיר דוד כדי לרמוס את ההווה של סילוואן". בשנה שעברה זעמו בארגון על הודעתו של השר לביטחון הפנים, גלעד ארדן, על "גידול מבורך" בעליית מבקרים יהודים בהר הבית. "עיר עמים" תהו מדוע ארדן "מתגאה בהתחזקות של תנועות המקדש? בתמיכה פוליטית בשוליים הכי סהרוריים של הימין הקיצוני? אלה שרוצים לפוצץ את כיפת הסלע, להקים בית מקדש שלישי, לחזור ליהדות של הקרבת קרבנות ולהקים מחדש את הסנהדרין? הפכת את המשטרה לכלי שרת של התנועות ההזויות האלה ועל זו גאוותך?".
בלשכתו של שר החינוך, הרב רפי פרץ, הביעו הסתייגות מהפרויקט, הממומן על ידי המשרד. ״אסור להקל ראש בסיורים מעין אלו. השר הורה לדרג המקצועי במשרד לבחון את הסוגיה בצורה יסודית".
מהמנהל לחינוך התיישבותי ופנימייתי במשרד החינוך נמסר: "באירוע המדובר נחשפו מורות חיילות למגוון רחב של עמדות ודעות בשיח הישראלי, ובין היתר, לעמדות של עמותת אלע"ד. יודגש כי ההתקשרות בוצעה על פי כל הנהלים ובהתאם לחוק חובת המכרזים".
מארגון "עיר עמים" נמסר כי "אנו שמחים לספק סיורי דרך אינפורמטיביים לכל מי שמעוניין להכיר מקרוב את הסוגיות הפוליטיות ומורכבות החיים בירושלים. במהלך השנים מעל 40 אלף איש השתתפו בסיורינו מכל קצוות הקשת הפוליטית ונשמח להמשיך להעניק את שירותינו לכל מבקש, כפי שנעשה עד היום".
