אור יהודה מזהמת את נחלי איילון וירקון ולכן אין לה שום קשר לפלמחים. זיהום הים באזור פלמחים נובע ככל הנראה מהמים הזורמים בנחל שורק לים. מקור הזיהום הוא שפכי העיר יבנה שעדין אינם מטוהרים כראוי ונשפכים לנחל שורק ליד עיינות.