שופטי בג"ץ, ממלא מקום הנשיאה עוזי פוגלמן, יצחק עמית ונועם סולברג הוציאו הערב (ה') צו ביניים האוסר על המשך תקצובם של תלמידי הישיבות החייבים בגיוס שאין בידם דחיית שירות בתוקף.
הצו הוצא זמן קצר בלבד לאחר שהיועמ"שית וראש הממשלה הגישו את תגובתם לבג"ץ. בהחלטתם השופטים אימצו את עמדת היועצת המשפטית לממשלה שהוגשה ומנוגדת לעמדתו של ראש הממשלה, לפיה לא ניתן חוקית להמשיך לתקצב את תלמידי הישיבות החייבים בגיוס.
על פי ההחלטה, "ניתן בזה צו ביניים האוסר על המשיבים… 5-1 לבצע העברות כספים לצורך תמיכה במוסדות תורניים, עבור תלמידי מוסדות תורניים שלא קיבלו פטור או דחייה משירות צבאי (מכוח ההסדר שהיה קבוע בפרק ג'1 לחוק שירות ביטחון) ולא התייצבו לגיוס מאז יום 1.7.2023 מכוח החלטת הממשלה; וביחס לתלמידי מוסדות תורניים שדחיית שירותם מכוח פרק ג'1 האמור פקעה והם לא התייצבו לגיוס מאז יום 1.7.2023 מכוח החלטת הממשלה. צו הביניים ייכנס לתוקפו ביום 1.4.2024".
אולם, בניגוד לעמדת היועצת סירבו השופטים לתת לישיבות אפילו תקופת הסתגלות קצרה וקבעו, "בשים לב, בין היתר, לעמדת היועצת המשפטית לממשלה בדבר אי-חוקיות העברת כספי התמיכות לאחר מועד זה, ובהיעדר מקור סמכות לכאורי להמשך התקצוב, לא ראינו להורות על הוראת מעבר". עם זאת, מוסדות שעקב הצו יפחת מספר תלמידיהם מתחת לרף המינימלי, יוכלו להמשיך לקבל תמיכות עבור התלמידים שאינם כלולים בצו עד סוף השנה.
בנוגע להמשך הדיון בעתירה קבעו השופטים כי המדינה תוכל להגיש הודעת עדכון בסוף חודש אפריל, וכי דיון בעתירות לגופן ייערך בחודש מאי, בהרכב של תשעה שופטים.